У редактора реестра есть ключ /e, который позволяет автоматически сохранять в reg-файле определенный раздел реестра. Это очень удобно, когда нужно сохранить настройки определенной программы, например, при ежедневном бэкапе. Экспорт может быть осуществлен как из командной строки так и из пакетного файла. Следующая команда сохраняет ключ реестра HKEY_CURRENT_USER\Software\Far в файл far.reg

regedit /e c:\far.reg HKEY_CURRENT_USER\Software\Far

В результате работы этой команды с корне диска С будет создан файл far.reg, который содержит все подразделы и параметры со значениями указанного раздела реестра. Для того, чтобы восстановить все настройки FAR будет достаточно запустить этот файл.
Для автоматизации сохранения ключей реестра можно написать пакетный файл, который будет запускаться Планировщиком в определенное время. Подробно про написание пакетных файлов можно прочитать в FAQ по пакетным файлам, а про работу с Планировщиком - в этой статье.